南京金陵高等职业技术学校建构“党政办公室”、“教学管理处”、“学生工作处”三个行政处室；“人事与财务服务中心”、“安全与后勤服务中心”、“教师发展中心”、“信息与诊改服务中心”、“合作与对外服务中心”五个服务中心；“汽车技术系”、“现代商贸系”、“艺术设计系”、“旅游营养系”、“形象设计系”五个系部主体的“355架构体系”。“小行政、大服务、实体化”的“355架构体系”有效解决“行政权力管理多、学术权力管理少；共性管理多、个性管理少；低层次管理多、高层次管理少”的“三多三少”问题，促进学校资源向一线教学倾斜；行政管理向服务师生转变；二级系部向市场主体升级。
